Développé à partir du début des années 60, le Centre Botanique du Jardin Exotique renferme une des plus importantes collections de cactus et plantes succulentes au monde. 

Cette structure, à laquelle est rattachée une équipe de 8 jardiniers spécialisés, regroupe un ensemble de serres et d'abris qui répond à deux objectifs : d'une part la culture des sujets destinés à prendre place dans le Jardin ou être exposés lors de Floralies et, d’autre part, la conservation d'une collection de référence de cactées et d'autres plantes succulentes assurant la protection de ces végétaux souvent rares et menacés dans la nature. Le Centre Botanique du Jardin Exotique de Monaco est ainsi détenteur d'un important patrimoine végétal enrichi en permanence et d’un véritable centre d’expertise technique, scientifique et culturel.

Le Centre Botanique, non ouvert au public, est accessible sur demande aux établissements d'enseignement et aux associations de botanique spécialisées.